Reflecție asupra implementării supravegherii genomice pentru COVID-19 și nu numai în Regiunea Africană

[ad_1]

De când primul său caz a fost raportat la 14 februarie 2020, regiunea africană a experimentat patru valuri distincte de COVID-19. De-a lungul fiecăruia dintre aceste proiecte, OMS a continuat să lucreze cu țările pentru intensificarea supravegherii genomice a agenților patogeni pentru a permite detectarea și răspunsul eficient la variantele SARS-CoV-2, prin investiții durabile în infrastructură și resurse umane.

Pentru a reflecta și a aprofunda această activitate, Biroul Regional al OMS pentru Africa (AFRO) a convocat o reuniune a punctelor focale epidemiologice COVID-19 de la ministerele sănătății din țările cu risc ridicat selectate în Brazzaville, Republica Congo, care a avut loc în perioada 10 august – 13, 2022. Obiectivul a fost să discutați inițiativele de îmbunătățire a calității și eficienței supravegherii COVID-19, inclusiv supravegherea genomică. Virologul regional OMS AFRO a pregătit scena:

„În prezent, 40 din cele 47 de state membre (85%) ale Regiunii Africane au capacități naționale de secvențiere a genomului și 46 de state membre (98%) își împărtășesc datele despre secvența genetică printr-o bază de date accesibilă publicului. Regiunea a stabilit un mecanism coordonat pentru a susține și se bazează pe aceste câștiguri și a înființat trei centre de excelență pentru supravegherea genomică, a dezvoltat documente de îndrumare standardizate, a oferit consolidarea capacităților personalului din ministerele sănătății și a creat un laborator de infrastructură pentru monitorizarea genomică de rutină a agenților patogeni, inclusiv monitorizarea apelor uzate..”

– Dr. Nicksy Gumede-Moeletsi, virolog regional, OMS/AFRO

Iată câteva momente importante ale poveștilor împărtășite de țări la întâlnire.

Etiopia

Capacitățile de secvențiere a genomului au fost stabilite în timpul pandemiei, iar datele generate continuă să sprijine luarea deciziilor în domeniul sănătății publice pentru COVID-19 și alte domenii prioritare ale bolii, cum ar fi rezistența antimicrobiană, folosind o abordare One Health. În ciuda câștigurilor promițătoare, Etiopia se confruntă în continuare cu diverse provocări pentru a îmbunătăți capacitatea și calitatea secvențierii, inclusiv: număr mic de laboratoare funcționale, lipsa de materiale de laborator și lipsa unei capacități bioinformatice suficiente pentru a analiza și interpreta datele de secvențiere. pentru acțiunea în timp util.

„Supravegherea genomică a jucat un rol important în informarea răspunsului la COVID-19 în Etiopia. Se elaborează o strategie națională de cinci ani pentru a ghida coordonarea și implementarea activităților de supraveghere pentru SARS-CoV-2 și alți agenți patogeni între 2022 și 2026. .

– Domnul Kebede Shitaye, Epidemiolog/Specialist în sănătate publică, Biroul de țară al OMS pentru Etiopia

Republica Democrată Congo

Folosind capacitățile de secvențiere genomică dezvoltate în timpul focarului de Ebola din 2018, Republica Democrată Congo a declanșat rapid secvențierea SARS-CoV-2 după ce a fost raportat primul caz. De atunci, laboratorul regional de referință al țării a secvențiat și mostre de SARS-Cov-2 din patru țări (Cad, Camerun, Republica Centrafricană și Republica Congo), cu sprijinul OMS și alți parteneri. Această capacitate de secvențiere este acum utilizată pentru alte boli naționale prioritare, cum ar fi variola maimuțelor, poliomielita, rujeola, malaria, holera și Yersinia pestis.

„Republica Democratică Congo a fost una dintre primele țări din lume care a partajat secvențe pentru SARS-CoV-2 în cadrul Inițiativei Globale privind Partajarea Datelor despre Gripa Aviară (GISAID). Prima secvență a fost lansată public pe 25 martie 2020, două săptămâni după raportarea primului caz. Ne angajăm să consolidăm capacitățile de secvențiere existente și să introducem activități de supraveghere genomică a mediului în viitorul apropiat.

– Dr Justus Nsio, Epidemiolog, Ministerul Sănătății, Republica Democrată Congo

Nigeria

Capacitățile de secvențiere genomică din Nigeria au fost construite în diverse instituții din sectorul public și privat, inclusiv Institutul Național de Sănătate Publică și centre academice și de cercetare, pentru a ajuta la informarea răspunsului la COVID-19. De la începutul pandemiei, Nigeria a partajat peste 7.000 de secvențe în cadrul Inițiativei Globale privind Partajarea Datelor despre Gripa Aviară (GISAID).

„Capacitatea de secvențiere construită în timpul pandemiei de COVID-19 ne oferă oportunitatea de a consolida supravegherea patogenilor genomici pentru alți agenți patogeni prioritari din țară. Ne angajăm să consolidăm coordonarea, capacitatea umană și infrastructura pentru supravegherea genomică.

– Dr. Abubakar Jafiya, epidemiolog, Centrul Nigeria pentru Controlul Bolilor, Nigeria

Africa de Sud

Africa de Sud a stabilit capacități de clasă mondială pentru supravegherea genomică de calitate și în timp util a SARS-CoV-2 și a altor agenți patogeni cu potențial de pandemie și epidemie, exemplificat prin înființarea în mai 2020 a Rețelei de Supraveghere Genomică în Africa de Sud, la două luni după primul a fost raportat un caz de COVID-19. Pentru a susține și a extinde câștigurile obținute, țara se angajează să mobilizeze resursele interne, să construiască forța de muncă și să îmbunătățească accesul la instrumentele de secvențiere a agenților patogeni în Africa de Sud și în alte țări.

„Printr-un mecanism solid de colaborare, Africa de Sud a secvențiat și partajat peste 44.700 de mostre de SARS-CoV-2 reprezentative pentru toate regiunile și vârstele într-o bază de date accesibilă publicului. Am construit o capacitate semnificativă de supraveghere a agenților patogeni pentru SARS-Cov-2 și alți agenți patogeni, și supravegherea genomică integrată în sistemul mai larg de supraveghere a sănătății publice.

– Dr Patrick Devanand, ofițer național, pregătire și răspuns în situații de urgență, biroul de țară al OMS pentru Africa de Sud

Rezultatele reuniunii și reflecțiile naționale cu privire la rolul supravegherii genomice în timpul pandemiei de COVID-19 și a altor urgențe de sănătate publică vor permite Regiunii să planifice și să integreze eficient supravegherea patogenilor în arhitectura mai largă a sănătății publice. În conformitate cu Strategia globală recent lansată pentru supravegherea genomică a agenților patogeni cu potențial de pandemie și epidemie 2022-2032, AFRO a lansat proiectul său emblematic Transforming African Surveillance Systems, care își propune să îmbunătățească supravegherea prin secvențierea genomică îmbunătățită a agenților patogeni și va încorpora constatările și lecțiile învățate de la întâlnirea din august.

Add Comment